Различни генетски мутации во некои случаи го зголемија преносот, па дури и можеби сериозноста на болеста.
Неколку варијанти на SARS-CoV-2, коронавирусот што предизвикува болест Ковид-19, се појавија низ целиот свет. Вирусите постојано мутираат, па затоа овие нови варијации не изненадија. Меѓутоа, кога модифицираната верзија ќе стане доминантна варијанта во регионот или онаа што ги загрижува, експертите за јавно здравје ги именуваат и следат тие варијанти.
Многу од таканаречените мутанти на SARS-CoV-2 покажуваат модификации на шилецот на протеинот на вирусот, кој вирусот го користи за прицврстување и напад врз човечките клетки. Како такви, различните генетски мутации во некои случаи ја зголемија преносливоста, па дури и можеби сериозноста на болеста поврзана со овие посебни варијанти. Live Science носи преглед на науката која стои зад варијантите на вирусот SARS-CoV-2, кои најмногу загрижуваат во различни области.
Загрижувачки варијанти
Алфа варијанта (B.1.1.7)
Алфа варијантата, наречена B.1.1.7, за прв пат е откриена во Велика Британија во септември 2020 година, според Светската здравствена организација (WHO). До декември 2020 година, варијантата се појавила и во САД.
Верзијата се проширила во најмалку 114 земји, според Глобалната мрежа на вируси, и е одговорна за околу 95% од новите инфекции со Ковид 19 во Велика Британија помеѓу 23 мај и 5 јуни 2021 година, околу 60% од вкупните случаи во САД биле поврзани со алфа варијантата, објави CDC.
Алфа варијантата има 23 мутации во споредба со оригиналниот вид од Вухан, со осум од нив во шилецот на протеинот на вирусот, според Американското здружение за микробиологија (ASM). Се смета дека три мутации на шилестиот протеин се одговорни за најголемото влијание врз биологијата на вирусот: Мутацијата N501Y се чини дека се зголемува во колку цврсто шилестиот протеин се врзува за рецепторите на ACE2 – главната влезна точка во човечките клетки; мутацијата 69-70del може, заедно со N501Y, да ја објасни зголемената преносливост на варијантата, велат некои научници; и мутацијата P681H исто така може да ја зголеми преносливоста, бидејќи може да биде вклучена во начинот на кој вирусот ја поврзува својата мембрана со човечката клеточна мембрана за да го испорача својот геном до клетката, според ASM.
Видот е околу 50% повеќе пренослив од оригиналната форма на новиот коронавирус, според Центрите за контрола и превенција на болести (CDC). Исто така, може да предизвика потешки случаи на Ковид 19, тврди CDC.
Претходните истражувања сугерираат дека две mRNA вакцини против Covid 19 (Pfizer и Moderna) се ефикасни во спречувањето на симптоматските инфекции со алфа варијанта на коронавирусот. Една студија објавена на 28 јуни во списанието Nature Communications покажа дека крвта на здравствените работници вакцинирани со вакцината Пфајзер е ефикасна во неутрализирањето на B.1.1.7. Една единечна доза на Johnson & Johnson исто така стимулира неутрализирачки антитела кои штитат од алфа варијантата, објави неодамна J&J.
Продолжува на страна 2
Бета варијанта (B.1.351)
Бета-варијантата, наречена B.1.351, за прв пат е откриена во Јужна Африка во мај 2020 година, а според СЗО е прогласена за загрижувачка варијанта во декември 2020 година. Според Глобалната мрежа на вируси, оваа варијанта е откриена во најмалку 48 земји и во 23 држави во САД.
Бета варијантата има осум различни мутации кои можат да влијаат на тоа како вирусот се врзува за клетките, претходно објави Live Science. Најистакнати се N501Y, K417N и E484K. Мутацијата N501Y, забележана во алфа варијантата, може да овозможи новиот коронавирус поцврсто да се поврзе со ACE2 рецепторот. Мутацијата K417N може да го смени обликот на шилецот на протеинот, правејќи ги антителата подготвени за претходните соеви потешко да го препознаат шилецот. Третата значајна мутација, E484K, исто така помага на вирусот да ги избегне антителата на имунолошкиот систем, според студијата од февруари објавена во British Medical Journal.
Бета-варијантата е околу 50% попренослива од оригиналниот SARS-CoV-2 вид што се појави во Вухан, според CDC. Според CDC, некои моноклонални антитела не делуваат добро против соеви. Вакцините се исто така помалку ефикасни против варијанта што може да доведе до нешто посериозно заболување и малку поголем ризик од смрт отколку во случајот на оригиналниот коронавирус, според јулското истражување на The Lancet Global Health.
Повеќето вакцини работат со помала ефикасност против бета варијантата отколку во случај на претходни соеви. Вакцината Пфајзер има 75% ефикасност во споредба со бета варијантата, што е пониска од 95% ефикасност забележана во клиничките испитувања кога доминирале претходните соеви, според студијата во мај 2021 година во The New England Journal of Medicine. Вакцините Johnson & Johnson и Novavax исто така покажаа помала ефикасност против бета варијантата. Вакцината AstraZenece не спречи благ или умерен COVID-19 во испитувањата во Јужна Африка кога бета беше доминантен вид, според Global Virus Network. Податоците за тоа колку вакцината Modern делува против бета варијантата се ограничени, но повеќето експерти претпоставуваат дека таа е ефективна слична на вакцината mRNA на Pfizer.
Продолжува на страна 3
Гама варијанта (P.1)
Најраните документирани примероци на варијантата гама, позната како P.1, беа собрани во Бразил во ноември 2020 година, според СЗО. Научниците најпрво ја пронашле варијантата во Јапонија на почетокот на јануари 2021 година, кога четворица патници биле позитивни на вирусот по патувањето во Бразил; истражувачите потоа нашле докази дека варијантата веќе била распространета во јужноамериканската земја, објави The New York Times. Гамата е обележана како загрижувачка варијанта на 11 јануари 2021 година.
Според новиот веб-портал на Обединетите нации, варијантата гама е пријавена во 74 земји во светот. Првата е откриена во САД во јануари 2021 година, а верзијата сега е забележана во најмалку 30 држави во САД, според CDC.
Гамата е тесно поврзана со бета (B.1.351) и двете варијанти делат некои исти мутации во своите шилци од протеинот, објави Times. Овие мутации на шилците го вклучуваат N501Y, кој помага вирусот цврсто да се поврзе со клетките, а исто така се наоѓа во алфа варијанта (B.1.1.7). Мутацијата на шилецот K417T исто така може да помогне гама да се прицврсти за клетките, додека мутацијата E484K веројатно ќе и помогне на варијантата да избегне одредени антитела. Според CDC, покрај овие три мутации, варијантата во шилецот носи осум дополнителни промени во низата: L18F, T20N, P26S, D138Y, R190S, D614G, H655Y и T1027I.
Неколку студии сугерираат дека гама е приближно двојно пренослива од нејзината матична коронавирусна лоза B.1.1.28, и дека гама инфекциите се поврзани со значително поголемо вирусно оптоварување од другите варијанти. Во споредба со матичниот вид на САРС-CoV-2, гама покажува помала подложност на неколку третмани со моноклонални антитела, вклучувајќи ги bamlanivimab и etesevimab, според CDC. И според неодамнешното истражување, објавено на 12 мај во списанието Cell Host & Microbe, верзијата, исто така, се чини дека е релативно отпорна на неутрализација на закрепнување од плазма и антитела од вакцинирани луѓе.
Современите вакцини против Covid 19 произведуваат неутрализирачки антитела против гама, иако вакцината е нешто помалку ефикасна против варијантата отколку против оригиналниот вид на вирусот, објави компанијата на 29 јуни. Вакцината на Pfizer покажа неодамна слично ниво на заштита од гама во една неодамнешна студија, објави Business Insider; и единечна доза на вакцината Johnson & Johnson, исто така, произведува неутрализирачки антитела против варијантата, според неодамнешното соопштение на компанијата.
Продолжува на страна 4
Делта варијанта (B.1.617.2)
Делта варијантата, која официјално е именувана како B.1.617.2, за првпат беше идентификувана во Индија во октомври 2020 година, а според СЗО беше назначена како загрижувачка варијанта во мај 2021 година.
Варијантата што брзо се шири е откриена во повеќе од 100 земји и забрзано станува доминантен вид ширум светот. Делта моментално ја потиснува алфа во САД; заклучно со 6 јули, CDC соопшти дека варијантата претставувала повеќе од половина од сите случаи во земјата.
Делта варијантата има неколку важни мутации во шилецот на протеинот, вклучително и T19R, del157 / 158, L452R, T478K, D614G, P681R, D950N мутации, според outbreak.info. Две од овие мутации – L452R и D614G – дозволуваат варијантата посилно да се поврзе со рецепторите на ACE2, претходно објавија Live Science. Други, како што е P681R, може да дозволат делтата да го избегне имунитетот на домаќинот.
Делта варијантата се смета за досега најпренослива верзија на новиот коронавирус – потенцијално до 60% повеќе пренослива од алфа варијантата и можеби двојно поголема зараза од оригиналниот вид на коронавирус што се појави во Вухан, Кина. Покрај тоа, некои докази сугерираат дека варијантата може полесно да ги избегне постојните вакцини отколку претходните верзии на коронавирусот.
Сите вакцини одобрени во САД веројатно делуваат против варијантата делта, иако сè уште не е јасно колку се ефективни. На пример, Public Health England откри дека вакцината на Pfizer е 88% ефективна против делтата варијанта, додека израелските здравствени власти известија дека вакцината на Pfizer е само 64% ефективна против делтата, објави The New York Times. Сепак, Израел не ги контролирал разликите кај луѓето кои биле вакцинирани и не биле вакцинирани, што ја отежнува интерпретацијата на податоците, пишува The New York Times. Вакцината на Pfizer продолжува да обезбедува силна заштита од сериозни болести и хоспитализација. Од Moderna тврдат дека нејзината вакцина ја неутрализирала варијантата делта, и иако тие сè уште не доставиле вистински податоци за инфекцијата, веројатно ќе дејствува слично на Pfizer. „Johnson & Johnson“ соопштија дека нивната вакцина произведува силна реакција на неутрализирање на антитела на делта варијанта, но тие не известуваат колку ги намалува шансите за симптоматска болест, објави претходно Live Science.
Продолжува на страна 5
Варијанти од интерес
Ета варијанта (B.1.525)
Варијантата ета, позната и како B.1.525, е идентификувана во Велика Британија и Нигерија во декември 2020 година, според CDC. Обележана е како варијанта од интерес на 17 март 2021 година, според СЗО. Заклучно со 9 јули, ета е пријавена во 68 земји во светот, според GISAID.
Поради присутните мутации, можно е третманот со вакцинирани моноклонални антитела, обновувачка плазма и антитела да не ја неутрализира варијантата ета толку ефикасно како неутрализираните претходни верзии на вирусот, според CDC.
Вакцината на Moderna произведува неутрализирачки антитела кои се насочени кон варијантата ета, иако нивниот ефект на неутрализирање е нешто помалку јак од оние против првичниот вид, објави компанијата на 29 јуни.
Јота варијанта (B.1.526)
Верзијата јота, наречена B.1.526, за прв пат е откриена во ноември 2020 година во New York, а беше означена како варијанта на интерес на 24 март 2021 година. Варијантата е откриена во најмалку 43 земји и во сите држави на САД. Во САД, оваа варијанта отпаѓа на 6% од сите примероци на SARS-CoV-2, откако е идентифицирана, според Универзитетот Stanford. Во светот, јота ја сочинува 2% од секвенците на коронавирусите.
Варијантата има две значајни мутации на протеинские шилци: D614G и T951. Се смета дека мутацијата D614G, пронајдена во неколку други верзии на SARS-CoV-2, му помага на вирусот поцврсто да се поврзе со рецепторите ACE2 на човечките клетки. Третата значајна мутација, наречена E484K, која се наоѓа и во протеинскиот шилец, предизвикува загриженост бидејќи се чини дека и помага на варијантата да избегне антитела на имунолошкиот систем.
Прелиминарните истражувања, детално опишани во извештајот на CDC на 16 мај, сугерираат дека варијантата на јота не предизвикува посериозен Covid 19 и не е поврзана со зголемен ризик од инфекција по вакцинирање или повторна инфекција. Сепак, откриените типови мутации укажуваат на можност вирусот да биде попренослив и да избегне некои делови на имунолошкиот систем.
Студија објавена на 24 март 2021 година, која е во печатење во списанието bioRxiv и треба да помине рецензија, сугерира дека mRNA вакцините на Moderna или Pfizer, се ефикасни против оваа варијанта.
Продолжува на страна 6
Капа варијанта (B.1.617.1)
Првпат е откриено во Индија во октомври 2020 година, а како варијанта на интерес е обележана на 4 април. Верзијата е откриена во најмалку 52 земји и 31 сојузна држава, соопшти Универзитетот Stanford. Од 24 јуни, капа варијантата учествува со помалку од 0,5% од сите анализирани секвенци на SARS-CoV-2 од моментот кога се појави.
Според извештајот на CDC на 12 мај, Капа има седум до осум мутации на протеинскиот шилец. Две од овие мутации, наречени L452R и E484Q, се наоѓаат на доменот за врзување на протеинските рецептори. Овие две мутации му помагаат на вирусот поцврсто да се закачи на рецепторите на ACE2 на човечките клетки. Се смета дека друга мутација на протеинот – D614G – го прави вирусот попренослив, додека таканаречената мутација P681R на протеинот може да биде одговорна за отпорноста на таа варијанта на антителата, објавија истражувачите во изданието на bioRxiv на 17 јуни.
Оваа варијанта е потенцијално пренослива и нешто помалку подложна на mRNA вакцините во споредба со оригиналниот вид на вирусот. Вакцините на mRNA против Ковид 19 (Moderna и Pfizer) не се толку ефикасни во неутрализирањето на оваа варијанта, се вели во дописот објавен на 7 јули во The New England Journal of Medicine. Сè уште не е јасно што значи ова за ефикасноста на вакцината против лесен, умерен или тежок Covid 19.
Ламбда варијанта (C.37)
Варијантата ламбда, позната и како C.37, за прв пат е откриена во Перу во август 2020 година. На 14 јуни, Светската здравствена организација (СЗО) го идентификува C.37 како глобална варијанта на интерес и го нарече ламбда. Досега, ламбдата е откриена во 29 земји, со високо ниво на ширење во земјите од Јужна Америка. Во последните месеци, варијантата е откриена во 81% од случаите на Ковид 19 во Перу кои биле подложени на генетско секвенционирање и 31% од случаите во Чиле кои биле подложени на генетско тестирање.
Некои од мутациите може да го зголемат преносот на вирусот или да ја намалат способноста на одредени антитела да го неутрализираат или деактивираат вирусот. На пример, ламбдата има мутација позната како F490S што е во доменот на врзување на рецепторот на шилестиот протеин (RBD), каде што вирусот најпрво се прикачува на човечките клетки. Една статија објавена во јули во списанието Genomics го идентификуваше F490S како веројатна мутација што може да избегне вакцини, да го направи вирусот позаразен и да ја наруши способноста на антителата генерирани од вакцината да препознаат варијанта.
Дали вакцините делуваат? Во моментов нема докази дека оваа варијанта предизвикува посериозна болест или ги прави тековно користените вакцини помалку ефикасни, според Public Health England.